Музей-заповедник много лет тесно сотрудничает с отечественными и зарубежными научными учреждениями. Уже в 2022 году было заключено несколько договоров, непосредственно связанных с проектными работами.
С Министерством культуры и туризма Турецкой Республики подписан Меморандум о сотрудничестве, также с Турецким агентством по сотрудничеству и координации (pdf),
Меморандум о сотрудничестве с Центром исследований исламской истории, искусства и культуры (IRCICA) (pdf)
Организацией сотрудничества Турецкой Республики (IRCICA), Центром археологии и археологии Восточной Азии г.Турин, Республика Италия (КРАСТ), Меморандум о взаимопонимании с Фондом музеев Турина (ФТМ),
Меморандум о сотрудничестве с «Узгунским Государственным историко-культурным музеем-заповедником» Кыргызской Республики (pdf)
Меморандум о сотрудничестве с Самаркандским государственным музеем-заповедником Республики Узбекистан (pdf).
Меморандум о взаимопонимании и сотрудничестве между Азербайджанским национальным музеем ковра (pdf)
Меморандум о взаимопонимании между государственным автономным учреждением культуры «Оренбургский губернаторский историко-краеведческий музей» (pdf)
Меморандум о сотрудничестве с Государственным бюджетным учреждением культуры и искусства Республики Башкортостан Национальный музей Республики Башкортостан (Российская Федерация) (pdf)
Меморандум о сотрудничестве между «Национальным историко-культурным музей-заповедником «Әзірет Сұлтан» и Федеральным государственным бюджетным учреждением культуры «Государственный Эрмитаж» (pdf)
Меморандум о взаимопонимании и сотрудничестве между Государственным историко-культурным заповедником «Кешикчидаг» при Государственной службы по охране, развитию и восстановлению культурного наследия Министерства культуры Азербайджанской Республики и Республиканским государственным казенным предприятием «Национальный историко-культурный музей-заповедник «Әзірет Сұлтан» Комитета культуры Министерства культуры и информации Республики Казахстан.(pdf)
Меморандум о взаимопонимании и взаимном сотрудничестве в области культурнрго наследия между Государственным историко-культурным заповедником «Чирагкала-Шабран» и Республиканским государственным казенным предприятием «Национальный историко-культурный музей-заповедник «Әзірет Сұлтан» Комитета культуры Министерства культуры и информации Республики Казахстан. (pdf)
Меморандум о сотрудничестве между Государственным бюджетным учреждением «Государственный историко-архитектурный и художественный музей-заповедник «Казанский Кремль» (Российская Федерация) и Республиканским Государственным казенным предприятием «Национальный историко-культурный музей-заповедник «Әзірет Сұлтан» Комитета культуры Министерства культуры и информации Республики Казахстан. (pdf)
Меморандум о сотрудничестве между Национальный историко-культурный музей-заповедник «Әзірет Сұлтан» и Национальный историко-культурный музей-заповедник «Несвиж» (Республика Беларусь). (pdf)
