Усыпальница Ходжа Ахмада Ясави — гур-хана, также квадратная в плане со сторонами 7,15 м, несет по центрам сторон одинаковые неглубокие ниши, украшенные, как и в казандыке, ажурными сталактитами. При реставрационных работах в помещении усыпальницы были выявлены небольшие фрагменты настенных росписей и, в частности, эпиграфический фрагмент на подкупольном фризе усыпальницы. Нижняя часть стен украшена мозаичной панелью из шестигранных плиток, покрытых зеленой глазурью.
На полу гур-ханы устроено прямоугольное возвышение размерами 4,7 х 3,8 м, высотой 46-50 см, сложенное из обожженого кирпича. В центре усыпальницы, в восточной части возвышения сооружено надгробие Ходжа Ахмада Ясави — уступчатый намогильник с навершием в виде арочки. Оно облицовано полированными бледно-зелеными плитами серпентинита-змеевика с белыми, желтыми и черными прожилками. Основание надгробия по периметру 1,05 х 2,94 м укреплено выступающими деревянными брусьями высотой 14 см,. Общая высота надгробия 1,85 м. В прошлом надгробие было прикрыто узорными покрывалами, одно из которых, судя по узорам, относится к XV в., имеет вышитые надписи.
Гур-хана перекрыта двойным куполом. Ганчевый декор скрывает нижний конструктивный купол. Снаружи гур-хана выделяется искусно декорированным ребристым куполом (имеет 52 ребра), поднятым на высокий барабан. Наружный диаметр купола усыпальницы Ходжа Ахмада Ясави равен 10 м..
Одна из двух входов в мавзолей, сохранившаяся в XIV веке, — дверь кабирхана. Эта дверь является отличной моделью средневековых орнаментальных дверей. Двери открываются двусторонними, украшенные мелкими костями, обрамлены жестью и позолоченными надписями. Верхней части дверей между двумя квадратами окаймленной узорчатыми цветами и листьями имеется тексты из хадисов Пророка с печатью сулуса. В центральной части двери, в полунке, надпись на персидском языке под подписью куфа: «Да Благословит». На дверной поверхности двух бронзовых пластин имеются надписи, написанные подписью сульса. Многие надписи стерты, частично читаются или приходят к чтению только некоторые слова и буквы, в написаниях встречаются выдержки из хадисов и мудрые слова.
