В северо-восточном отсеке здания располагаются Большой Аксарай и лежащий напротив Малый Аксарай. Название помещений связано не с их цветом («ак-сарай» означает в дословном переводе «белая палата дворец»), а с использованием их в качестве дворцовых помещений в XVI-XVIII вв., когда в Туркестане размещалась резиденция казахских ханов Старшего и Среднего жузов, на что в свое время обратил внимание Т.К. Басенов. Большой и Малый Ак-сарай имеют проходные галереи на втором ярусе.

В г. Туркестане казахские ханы принимали инострастранных послов. В русских источниках сохранилось описание приема российских послов 22 июля 1694 г. Тауке ханом (1652-1717).

Малый Аксарай — помещение, где на протяжении шестисот лет хоронили самых уважаемых людей.